Es ist eine beeindruckende Zahl: Über 100 junge Sänger wirken aktiv im Knabenchor der Jenaer Philharmonie mit. Die Chorarbeit findet in vier Chorgruppen statt. Im gemischten Konzertchor singen ca. 70 Knaben und junge Männer. Der Vorkurs für Knaben der Altersstufe der 1. und 2. Klasse legt die Grundlagen für die künftige Sängertätigkeit. Danach wechseln die Knaben in den Nachwuchschor, wo sie weiter ausgebildet und für die Zeit im Konzertchor vorbereitet werden. Die Männerstimmen des Knabenchores bilden zusätzlich einen eigenständigen Chor, der sich der umfangreichen Literatur für Männerchöre widmet.

Im Jahr 1976 gegründet, wurde der Chor unter der künstlerischen Leitung von Michael Pezenburg (1976-1983) und Jürgen Puschbeck (1983-1999) schnell über die Grenzen Jenas hinaus bekannt. Seit dem Jahr 2000 ist Berit Walther die Dirigentin des Chores.

Der Jenaer Knabenchor kann auf zahlreiche erfolgreiche Teilnahmen bei Wettbewerben zurückblicken. Im Jahr 2014 holte der Männerchor des Jenaer Knabenchores den 2. Preis beim Bundeschorwettbewerb; 2018 belegte er den 3. Platz.

Konzertreisen führten den Jenaer Knabenchor durch ganz Deutschland, nach Frankreich, Russland, Slowenien und Estland. Er ist Teil eines Netzwerks unter dem Titel „Knabenchor meets friends“, in dem Kinderchöre aus Deutschland, sowie ein norwegischer und ein estnischer Chor sich gegenseitig zu gemeinsamen Konzerten besuchen.

In der Spielzeit 2019.2020 steht in dieser Reihe die Aufführung von Gioachino Rossinis „Petite Messe solennelle“, die zusammen mit der Wuppertaler Kurrende realisiert werden wird.